Na področju zdravstvenega varstva organ SIS opravlja naslednje naloge:
-
odloča o razdelitvi finančnih sredstev, določenih v Skupščini SR Slovenije za program zdravstvenega varstva za leto 1990 po območjih, in sredstev za naloge skupnega pomena,
-
sprejema enotna merila in kriterije za sklepanje pogodb z izvajalci.