Člani komisije na prvi seji izvolijo izmed sebe predsednika in podpredsednika komisije za obdobje enega leta, tako da je vsako leto izvoljen predstavnik drugega ministrstva.
Če je predsednik komisije odsoten, opravlja njegove naloge podpredsednik komisije.
Strokovno tehnična dela za komisijo opravljajo upravni delavci pristojnega organa in Urada Republike Slovenije za kemikalije.
Predsednik komisije lahko v soglasju s pristojnim organom, Uradom Republike Slovenije za kemikalije in ministrstvom, pristojnim za okolje, povabi k sodelovanju tudi druge strokovnjake, ki niso člani komisije, če je to potrebno za preučitev in obravnavo posameznih vprašanj, ki sodijo v njeno delovno področje. Strokovnjaki, ki niso člani komisije, nimajo pravice do glasovanja.
Administrativna dela za potrebe dela komisije opravlja tajnik, ki ga zagotovi pristojni organ.