Organ upravljanja inštituta je upravni odbor.
Upravni odbor ima skupaj s predsednikom 11 članov, od katerih imenujejo:
-
4 člane ustanovitelji na predlog Ministrstva za znanost in tehnologijo,
-
2 člana ICPE,
-
1 člana Univerza v Ljubljani,
-
1 člana Univerza v Mariboru,
-
1 člana SAZU,
-
1 člana inštitut iz vrst odgovornih nosilcev raziskovalnih in razvojnih projektov in
-
1 člana iz vrst zaposlenih.
Predsednika upravnega odbora izvolijo člani upravnega odbora izmed sebe.