Če je zahteva za ponovno ocenitev prijave pravočasna in jo je vložila upravičena oseba, morata MZT in sodelujoče ministrstvo v desetih dneh od prejema zahteve ponovno preveriti pravilnost postopka in svojo odločitev o izbiri.
Pri ponovnem preverjanju se lahko sklep o financiranju in določitvi izvajalcev spremeni. O zahtevi odločita minister, pristojen za znanost in tehnologijo in minister sodelujočega ministrstva po predhodno opravljenem postopku, opredeljenim za ocenjevanje prijav na razpis po tem pravilniku.