Program dela za posamezen namen iz točke C 1. člena uredbe sprejme minister na podlagi letnih programov zainteresiranih vlagateljev, ki jih oceni posebna komisija, ki jo imenuje minister.
Komisija izdela predlog programa, v katerem določi tudi višino sredstev za posameznega upravičenca.
Na podlagi sklepov o dodeljenih sredstvih in letnih programov ministrstva sklene ministrstvo z upravičenci pogodbe, s katerimi natančneje uredi način in pogoje koriščenja dodeljenih sredstev.