1.
Slovenija je pooblastila nacionalni javni organ, da v njenem imenu deluje kot nacionalni koordinacijski organ (glej Ureditev za partnersko državo). Nacionalni koordinacijski organ je v celoti odgovoren za doseganje ciljev Slovensko-švicarskega programa sodelovanja in njegovo izvajanje v skladu s tem Okvirnim sporazumom.
2.
Švica je pooblastila Zvezno ministrstvo za zunanje zadeve, ki deluje prek Švicarske agencije za razvoj in sodelovanje (SDC), in Zvezno ministrstvo za gospodarske zadeve, izobraževanje in raziskave, ki deluje prek Državnega sekretariata za gospodarske zadeve (SECO), da delujeta v njenem imenu pri izvajanju Slovensko-švicarskega programa sodelovanja. Ukrepi podpore se dodelijo SDC ali SECO v skladu z njunimi področji pristojnosti.