Vloge prispele na javni razpis pregleda in oceni komisija, ki jo za ta namen s soglasjem ministra za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano imenuje direktor ARSKTRP. Komisijo sestavljajo predstavnik MKGP, predstavnik ARSKTRP in eden ali več zunanjih strokovnjakov z ustreznim strokovnim znanjem.
O pregledu in oceni vlog sestavi komisija zapisnik, ki mora vsebovati zlasti:
Zapisnik podpišejo vsi člani komisije. Po končanem delu komisija o predlogu seznani direktorja ARSKTRP in pristojnega državnega sekretarja na MKGP.
Zunanji člani razpisne komisije so upravičeni do potnih stroškov in sejnine.
Prepozno prispele vloge se zavržejo, neutemeljene pa zavrnejo. Predlagatelje nepopolnih vlog se pozove, da vloge dopolnijo v roku, ki je določen v javnem razpisu. Nepopolne vloge, ki jih predlagatelj v navedenem roku ne dopolni, se zavržejo.
Na podlagi zapisnika komisije odloči o vloženih zahtevkih direktor ARSKTRP z odločbami v roku 60 dni po izteku razpisnega roka. Vlagatelji, katerim sredstva ne bodo dodeljena, bodo o tem pisno obveščeni z odločbami v roku 90 dni po izteku razpisnega roka.
Zoper odločbo iz prejšnjega odstavka se lahko vloži zahteva za ponovno preveritev postopka na ministrstvo, pristojno za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano, v roku 15 dni od dneva vročitve odločbe vlagatelju. Prepozno vložene zahteve za preveritev postopka se zavržejo. O rezultatih ponovne preveritve postopka odloči minister za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano z odločbo.