Na podlagi prejetih prijav komisija pripravi program dela.
UE predloži pristojni veterinarski inšpekciji program dela komisije. Glede na ta program veterinarska inšpekcija z odločbo določi pristojni primarni veterinarski organizaciji s koncesijo, roke za izvedbo predpisanih pregledov in določi datume odvzema vzorcev krvi plemenjakom. Stroške preiskav na kužne bolezni, ki so predpisane, vendar se ne odkrivajo in preprečujejo po odredbi o izvajanju preventivnih ukrepov zaradi odkrivanja in preprečevanja živalskih kužnih bolezni v tekočem letu, plača imetnik plemenjaka.
Vzorce krvi je treba odvzeti najmanj 20 dni pred napovedanim datumom komisijske ocene in odbire plemenjakov. Primarna veterinarska organizacija mora v roku 7 dni članu komisije iz VZS posredovati fotokopijo zapisnika o odvzemu vzorcev krvi.
Veterinarski inštitut Slovenije mora opraviti preiskave vzorcev krvi v 14 dneh in jih takoj posredovati primarni veterinarski organizaciji in članu komisije VZS.