Organ upravljana Inštituta je Upravni odbor.
Upravni odbor Inštituta ima pet članov, od katerih:
-
dva člana imenuje ustanovitelj, in sicer enega člana na predlog ministrstva, pristojnega za raziskovalno dejavnost, in enega člana na medsebojno usklajeni predlog soustanoviteljev Slovenske akademije znanosti in umetnosti ter Univerze v Ljubljani;
-
dva člana imenuje znanstveni svet Inštituta iz vrst uporabnikov Inštituta, ki imajo dolgoročen interes pri povezovanju raziskovalnih dejavnosti Inštituta, oziroma zainteresirane javnosti, kot so javni zavodi in manjšinske institucije oziroma organizacije;
-
enega člana izvolijo zaposleni delavci Inštituta izmed sebe.
Predsednika Upravnega odbora izvolijo člani Upravnega odbora izmed sebe.
Način imenovanja članov iz vrst uporabnikov dejavnosti Inštituta, ki imajo dolgoročen interes pri povezovanju raziskovalnih dejavnosti Inštituta, oziroma zainteresirane javnosti in izmed zaposlenih delavcev na Inštitutu se podrobneje določi v statutu.