(1)
Ne glede na prvi odstavek 82. člena ZZDej in ne glede na 49. člen ZIUZDS ministrstvo, pristojno za zdravje, če obstajajo razlogi za sum, da so pri izvajalcu zdravstvene dejavnosti nastale nepravilnosti v zvezi z izvajanjem zdravstvene dejavnosti, delovnega procesa ali kakovostjo in varnostjo zdravstvene obravnave, ki zahtevajo nadzor nad izvajanjem predpisov s področja opravljanja zdravstvene dejavnosti in zdravstvenega zavarovanja ter področja materialnega poslovanja in nadzor kakovosti, odredi sistemski nadzor, ki se izvede kot izredni nadzor.
(2)
Minister, pristojen za zdravje, lahko za namen celovitega nadzora k sočasni izvedbi nadzora iz druge, pete in šeste alineje prvega odstavka 76. člena ZZDej pozove tudi Zavod za zdravstveno zavarovanje Slovenije, pristojne zbornice oziroma strokovna združenja in inšpekcijske organe iz 83.a člena ZZDej, ki izvedejo nadzor v skladu s svojimi pooblastili in ministra, pristojnega za zdravje, obvestijo o ugotovitvah nadzora, morebitnih izrečenih ukrepih in realizaciji ukrepov. V primeru poziva iz prejšnjega stavka pristojna zbornica oziroma strokovno združenje izvede strokovni nadzor s svetovanjem tudi izven letnega programa, ministru, pristojnemu za zdravje, pa pozvane institucije posredujejo povzetek poročila o ugotovitvah opravljenega nadzora ter informacije o odrejenih in izvedenih ukrepih.
(3)
Ne glede na drugi odstavek 82. člena ZZDej sistemski nadzor pomeni sočasno izvedbo izrednega upravnega nadzora in izrednega nadzora kakovosti, ki ga določa zakon, ki ureja zagotavljanje kakovosti v zdravstvu, pri čemer člane komisije za nadzor področja kakovosti na poziv ministra, pristojnega za zdravje, določi Javna agencija Republike Slovenije za kakovost v zdravstvu. Sistemski nadzor vodi predsednik komisije za izvedbo sistemskega nadzora, ki je predstavnik ministrstva, pristojnega za zdravje, vsak član komisije pa izvede nadzor v skladu s pooblastili in postopki izvajanja posamezne oblike nadzora.
(4)
Ne glede na četrti odstavek 82. člena ZZDej minister, pristojen za zdravje, postopek in način izvajanja sistemskega nadzora določi v sodelovanju z Javno agencijo Republike Slovenije za kakovost v zdravstvu.