Za pripravo strokovnih podlag za odločanje komisije lahko komisija ustanovi stalne ali občasne strokovne podkomisije, ki so praviloma sestavljene iz neodvisnih strokovnjakov, ki sicer niso člani komisije.
Delo komisije in njenih podkomisij koordinira sekretar komisije, ki je delavec Urada za kemikalije Republike Slovenije in v sodelovanju z Uradom za kemikalije Republike Slovenije opravlja vsa strokovna, tehnična in administrativna dela za potrebe komisije. Sekretar ni član komisije.