Specialni zavod oziroma inštitut opravlja naloge za več vrst ali za določeno vrsto zdravstvene dejavnosti ter na tem področju opravlja raziskovalno in proučevalno delo.
Specialni zavod oziroma inštitut na svojem delovnem področju strokovno in metodološko pomaga drugim zdravstvenim organizacijam, spremlja njihovo delo in uvaja v prakso izsledke svojih proučevanj.
Specialni zavod oziroma inštitut se ustanovi za širše gravitacijsko območje, praviloma za potrebe vse SR Slovenije.