Vodenje obratovanja kot sistemska storitev obsega vse UPO-jeve naloge v okviru koordinacije angažiranja proizvodnih enot in vodenja omrežja ter obratovanje EES-a v interkonekciji UCTE. Obratovanje se vodi iz centra vodenja ali v posebnih primerih iz rezervnega centra vodenja sistema. Center vodenja izvaja tudi potrebne ukrepe za zagotovitev pogojev za merjenje in obračun vseh opravljenih storitev.
Vodenje obratovanja sledi ciljem načrtovanja obratovanja in nepretrgano preverja sigurnost EES-a, da se v okviru trenutno razpoložljivih obratovalnih možnosti obvladajo posledice motenj in okvar.