V državnem proračunu se določi višina sredstev za:
Inštitut pridobiva sredstva iz prve, druge in tretje alinee prejšnjega odstavka na podlagi Programa dela inštituta h kateremu je dala soglasje Vlada RS. Program je pripravljen za obdobje petih let in vsebuje:
Program dela inštituta pripravi direktor na predlog vodij programskih skupin, v skladu s predpisi ministrstva, pristojnega za znanost. Upravni odbor inštituta po predhodnem mnenju znanstvenega sveta sprejme Program dela Inštituta.
Inštitut pridobiva sredstva iz četrte alinee prvega odstavka tega člena v obsegu izvajanja nalog javne službe s področja kmetijstva iz petega odstavka 3. člena tega sklepa in nalog s področja kmetijstva iz šestega odstavka 3. člena tega sklepa na podlagi letnih programov, sprejetih na predpisan način, in na podlagi predpisov, ki urejajo javno naročanje.
Inštitut pridobiva sredstva iz pete alinee prvega odstavka tega člena v obsegu izvajanja nalog s področja okolja iz sedmega odstavka 3. člena tega sklepa na podlagi letnega programa, ki ga po predhodnem soglasju ministrstva, pristojnega za okolje, sprejme upravni odbor inštituta.