39. člen
(nadzor nad delom in poslovanjem)
(1)
Nadzor nad zakonitostjo, učinkovitostjo in uspešnostjo dela agencije opravlja ministrstvo, pristojno za zdravje.
(2)
Ministrstvo, pristojno za finance, v agenciji opravlja nadzor skladno z zakonom, ki ureja javne agencije.
(3)
Ministrstvo, pristojno za upravo, opravlja nadzor nad izvajanjem predpisov o upravnem postopku, poslovnem času, uradnih urah, poslovanju s strankami in z dokumentarnim gradivom ter o zagotavljanju javnosti delovanja.