(1)
Zavod upravlja svet zavoda.
(2)
Svet zavoda sestavlja devet članov, in sicer:
-
pet predstavnikov ustanovitelja, od katerih ustanovitelj imenuje dva na predlog ministrstva, pristojnega za ohranjanje narave (v nadaljnjem besedilu: pristojno ministrstvo), in po enega na predlog ministrstva, pristojnega za kulturo, ministrstva, pristojnega za kmetijstvo in gozdarstvo, ter službe Vlade Republike Slovenije, pristojne za strukturno politiko in regionalni razvoj;
-
en predstavnik delavcev zavoda, ki ga izvolijo zaposleni izmed vseh zaposlenih v zavodu;
-
trije predstavniki parkovnih lokalnih skupnosti, od katerih imenuje Občina Izola enega in Občina Piran dva, od tega enega na predlog Krajevne skupnosti Strunjan.
(3)
Mandat članov sveta zavoda je štiri leta. Po preteku mandata je lahko član sveta ponovno imenovan ali izvoljen.