Pri projektih, ki so vključeni v programe mednarodnega znanstvenega in tehnološkega sodelovanja in je v tem okviru opravljeno mednarodno strokovno ocenjevanje, se postopek ocenjevanja, ki ga določa pravilnik, ki ureja (so)financiranje temeljnih, aplikativnih in podoktorskih projektov v delu, ki se nanaša na recenzijo, ne opravi, če je recenzija dostopna agenciji.
Če recenzija pri prijavah s slovenskim nosilcem mednarodnega projekta (npr. na javne razpise Evropskega raziskovalnega sveta (ERC), projektov ERA-NET, v katerih sodeluje Republika Slovenija, ter shem EUROCORES pri Evropski znanstveni fundaciji (ESF), ali s slovenskim koordinatorjem projekta na javne razpise okvirnih programov EU) preseže prag za možno sofinanciranje (threshold), ni pa projekt izbran za sofinanciranje pri Evropski komisiji ali ESF, oziroma je bil v primeru ERC pozitivno ocenjen v prvem krogu in/ali predlagan za drugi krog ocenjevanja, lahko agencija prevzame sofinanciranje v obsegu, ki ga predlaga znanstveni svet agencije in potrdi upravni odbor agencije.