Nacionalni znanstveno-raziskovalni svet sestavljajo predsednik, namestnik predsednika in člani.
Predsednika in namestnika predsednika imenuje minister.
Člani Nacionalnega znanstveno-raziskovalnega sveta po funkciji so predsedniki znanstveno-raziskovalnih svetov za posamezna področja in predsednik znanstveno-raziskovalnega sveta za področje narave in kulture Slovenije in Slovencev.
Predsednika imenuje minister izmed kandidatov na predlog Koordinacije raziskovalnih inštitutov Slovenije – KORIS, Sveta za znanost in tehnologijo Republike Slovenije, Nacionalnega znanstveno-raziskovalnega sveta, Univerz in Slovenske akademije znanosti in umetnosti in po predhodno opravljeni javni predstavitvi predlaganih kandidatov. Javno predstavitev kandidatov organizira ministrstvo. Kandidat za predsednika je lahko tudi član Nacionalnega znanstvenega sveta.
Predsednik oziroma namestnik predsednika Nacionalnega znanstveno-raziskovalnega sveta v času svojega mandata ne more opravljati funkcije predsednika oziroma namestnika predsednika znanstveno-raziskovalnega sveta oziroma funkcije nacionalnega koordinatorja.
Za predsednika oziroma namestnika predsednika Nacionalnega znanstveno-raziskovalnega sveta praviloma ne more biti imenovan rektor univerze, dekan fakultete oziroma visoke strokovne šole in direktor javnega raziskovalnega zavoda.
Namestnika predsednika nacionalnega znanstveno-raziskovalnega sveta imenuje minister na predlog predsednika sveta.
Predsednik in njegov namestnik se imenujeta za tri leta in sta lahko največ dvakrat zaporedoma imenovana na isto funkcijo.
Mandat članov Nacionalnega znanstveno-raziskovalnega sveta je enak mandatu predsednikov znanstveno-raziskovalnih svetov za posamezna področja.